Бұрын органоидтар деп те аталатын органеллалар (орган және басқа грек тілінен εἶδος — «тип») жасушаның тұрақты компоненттері болып табылады. Олар жасушаның ішкі бөлігінде – цитоплазмада орналасады, онда органоидтармен бірге әртүрлі қосындылар болуы мүмкін.
Органеллалар мембраналық (бір мембраналық немесе қос мембраналық) және мембраналық емес болып бөлінеді. Бір мембраналы жасушаларға эндоплазмалық тор, Гольджи аппараты, лизосомалар, вакуольдер, пероксисомалар және плазмалық мембрана жатады. Қос мембранаға митохондриялар, пластидтер және жасуша ядросы жатады. Мембраналық еместерге рибосомалар мен жасуша орталығы жатады. Жасушаның маңызды, бірақ үнемі өзгеріп отыратын құрылымы цитоскелет жеке қарастырылады.

Цитоплазма
Негізгі мақала: Цитоплазма
Жасуша органоидтары цитоплазмада орналасқан, оның ішкі ортасын құрайтын гиалоплазмадан тұрады. Гиалоплазма – белоктардың, ферменттердің, көмірсулардың, нуклеин қышқылдарының және басқа заттардың біртекті күрделі коллоидты жүйесі. Оның қызметі жасушаішілік құрылымдарды біріктіру және өзара әрекеттесуін қамтамасыз ету болып табылады: гиалоплазмада белок биосинтезі жүреді, гликоген мен май қосындылары тұнбаға түседі, митохондриялар әрекеті кезінде түзілетін АТФ жинақталады.
Эндомембралық жүйе
Барлық органеллалар мембраналары, соның ішінде плазмалемма – жасушаның сыртқы қабығы липидті молекулалардың екі қабатынан тұратын жұқа липопротеидті қабықшалар. Қабықшаның бетінде және қалыңдығында әртүрлі ақуыздар бар. Органикалық заттардың шамамен қатынасы: 25-60% липидтер, 40-75% белоктар, 2-10% көмірсулар мембрана ерекшеліктеріне байланысты. Мембраналардың функцияларына мыналар жатады: органелланың немесе жасушаның тұтастығын сақтау, заттарды тасымалдау, сыртқы сигналдарды қабылдау, жасушааралық байланыстарды құру.
Ядролық аппарат
Ядролық аппарат — бұл генетикалық материалды сақтау мен жүзеге асыруды жеңілдететін арнайы компоненттері бар жасуша аймағы. Эукариот ядросы қос мембраналы ядролық қабықтан, хроматиннен, ядрошықтан, матрицадан және кариоплазмадан тұрады. Ядролық қабықтың кейбір жерлерінде мембраналар жабылып, ядролық кеуектерді — заттарды тасымалдайтын ақуыз молекулаларының күрделі кешендері бар мембрананың бөлімдерін құрайды. Прокариоттарда жасуша ядросының аналогы – нуклеоид немесе нуклеоплазма болады. Нуклеоидты аймақ жасуша ядросынан айырмашылығы, цитоплазмадан мембрана арқылы бөлінбейді және оның құрамында рибосомалар, әртүрлі түйіршіктер мен мембраналар болады.
Эндоплазмалық ретикулум
Эндоплазмалық ретикулум (ER) — әртүрлі синтетикалық процестер қатар жүретін оқшауланған резервуарлар жиынтығы болып табылатын стектер мен түтіктерден тұратын жасушаішілік гетерогенді мембраналық құрылым. ER екі түрге бөлінеді: түйіршікті немесе өрескел және тегіс. Дөрекі ЭР бетінде белок синтезіне қатысатын көп мөлшерде түйіршіктер – рибосомалар немесе полисомалар болады. Тегіс ER өрескел ER-ден түзіледі және триглицеридтер мен липидтердің синтезіне қатысады.
Рибосома
Рибосома — ақуыз биосинтезіне маманданған мембраналық емес органоид. Жасуша рибосомалық РНҚ-ның басымдылығын анықтайтын органеллалардың үлкен санымен ұсынылған. Рибосома бірқатар спецификалық белоктардан және бірнеше рРНҚ-дан тұрады. Жұмыс істейтін рибосомалық кешен кіші және үлкен деп аталатын екі суббірліктен тұрады. Рибосома синтезінің орны — ядрошық.
Гольджи кешені
Гольджи аппараты (кешені) – мембраналық құрылымдар тобы болып табылатын органоид. Қабықшалардың жиналуы диктиосома деп аталады, онда мембраналық қапшықтар цистерна түрінде орналасады. Аппараттың шеткі бөлігінде цистерналардың шетінен бөліну нәтижесінде пайда болатын ұсақ вакуольдер (везикулалар) болады. Гольджи кешені ЭР-де синтезделген заттардың жинақталуына, сұрыпталуына және шығарылуына қатысады. Тегіс ER-мен бірге Гольджи аппараты лизосомалардың түзілуіне қатысады.
Лизосомалар
Лизосомалар – экзогендік және эндогендік биологиялық макромолекулалардың ыдырауына қатысатын мембраналық жасушаішілік бөлшектер, Гольджи аппаратының көпіршіктері. Лизосомалар ішінде әртүрлі гидролитикалық ферменттердің көп саны бар және олар ішкі олигосахаридтер аймақтарымен өздігінен қорытылуынан қорғалған. Ферменттердің жұмыс істеуін қолдау үшін АТФ-мен жұмыс істейтін протонды сорғы арқылы рН 5 деңгейінде сақталады.
Цитоскелет
Цитоскелет үш элементтер тобынан тұратын жасушаның тірек-қимыл аппараты болып табылады: микрофиламенттер – жіптердің барлық топтарының ішіндегі ең жіңішкесі, жуан микротүтікшелер, орташа аралық жіпшелер. Бұл компоненттердің барлығы жасушалық компоненттердің қозғалысының ішкі процестеріне және жасушаның өзінің қозғалысына қатысады. Пассивті түрде цитоскелет қаңқа қызметін атқарады.
Жасушалық орталық микротүтікшелерді ұйымдастыру, олардың түзілуі мен өсуін қамтамасыз ететін орталық болып табылады. Жасуша орталығы цитоскелеттің қалыптасуында және жасушаның бөлінуінде маңызды рөл атқарады. Жасуша орталығының құрамына кіретін центросомалар бөліну шпиндельінің түзілуіне қатысады және жасушаның полюстерін анықтайды. Жасуша орталығы ядроға жақын орналасқан және тығыздалған матрицамен қоршалған.
Эндосимбионттар
Симбиотикалық теория бойынша митохондриялар мен хлоропласттар еркін тіршілік ететін бактериялар мен прокариот иелерінің симбиозынан пайда болды. Митохондриялардағы жасушалық тыныс алу қызметі және хлоропластардағы фотосинтез процесі толыққанды эукариоттық организмдер пайда болғанға дейін көп бұрын пайда болғаны нақтыланған.
Митохондрия
Митохондриялар, әдетте хондриосомалар, «жасушаның энергетикалық станциялары» деп аталады, олардың қызметі органикалық қосылыстардың тотығуы және тотыққан қосылыстардың энергиясын пайдаланып АТФ кейіннен синтезі болып табылады (жасушалық тыныс алуды қараңыз). Мүмкін болатын өлшемдер мен пішіндердің алуан түрлілігіне қарамастан, митохондриялар тұрақты күрделі қос мембраналық құрылымға ие. Олар цитоплазмадан сыртқы қабықшамен бөлінген, ал ішкі жағында көптеген қатпарлары – кристалдары бар, митохондриялық ДНҚ, РНҚ, митохондриялық рибосомалар және әртүрлі қосындылары бар матрица болады.
Пластидтер
Пластидтер — фототрофты эукариоттық жасушаларда кездесетін қос мембраналы органоидтар. Митохондриялар сияқты, пластидтік матрицада өзінің ДНҚ, РНҚ және ақуыз синтездейтін аппараты болады. Пластидтер хлоропласт, лейкопластар, хромопластар болып бөлінеді. Ең маңыздысы — хлоропласт, фотосинтезге ықпал ететін хлорофилл пигменті бар қос мембраналы органоид. Сыртқы мембрана пластидті цитоплазмадан бөледі, ал ішкі мембрана строманы қоршайды (митохондрия матрицасына ұқсас). Ішкі мембрана жалпақ, ұзартылған, бір-бірімен байланыспаған ламеллаларды немесе стекаларға (граналарды) реттелген тилакоидтарды құра алады.